Миссия: создание условий по сохранению, восстановлению и улучшению качества окружающей среды с учетом тенденций изменения климата, сохранению биологического разнообразия, водообеспечению отраслей экономики и окружающей среды, обеспечению перехода Республики Казахстан к низкоуглеродному развитию и «зеленой» экономике для повышения благосостояния, качества жизни населения при минимизации нагрузки на окружающую среду и деградации природных ресурсов посредством интеграции экономических, социальных и природоохранных аспектов.
Вместе с тем, ежегодно экологической инспекцией расширяется охват количества проверяемых объектов, уменьшается общее количество проверок. При этом из года в год по среднестатистическим данным наблюдается уменьшение количества правонарушений на единицу проверки (2008 год - 0,98; 2009 год - 0,95; 2010 год - 0,81; 2011 год - 0,76).
На основании 9 судебных решений в республиканскую собственность передано 4,7 млн. тонн опасных отходов, признанных бесхозяйными. В соответствии с Правилами управления бесхозяйными опасными отходами, признанными решением суда поступившими в республиканскую собственность, утвержденными постановлением Правительства Республики Казахстан от 31 мая 2012 года № 715, процедура управления такими объектами требует комплексного изучения их физико-химических и прочих свойств, а также всесторонних исследований для принятия решений по их дальнейшему безопасному управлению.